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B4: Simulationen mit räumlich adaptiver Auflösung in allgemeiner Hamilton-basierter Form

Methoden mit räumlich variabler Auflösung, bei denen die Teilchen dynamisch zwischen verschiedenen Ebenen der Darstellung wechseln können, ermöglichen ganz neue skalenübergreifende Simulationen für Flüssigkeiten und weicher kondensierter Materie. Im vorliegenden Projekt soll ein bereits entwickeltes Verfahren zur Simulation mit räumlich variabler Auflösung (AdResS - adaptive resolution simulation scheme) so erweitert werden, dass beliebige Hamiltonfunktionen benutzt werden können. Mit diesen methodischen Entwicklungen werden z.B. teilchenbasierte adaptive Simulationen mit explizit langreichweitigen Potentialen oder adaptive QM/MM Simulationen, bei denen der hochaufgelöste Teil der Simulation vollständig quantenmechanisch behandelt wird, möglich.


From Classical to Quantum and Back: A Hamiltonian Scheme for Adaptive Multiresolution Classical/Path-Integral Simulations
Karsten Kreis, Mark E. Tuckerman, Davide Donadio, Kurt Kremer, Raffaello Potestio
J. Chem. Theory Comput. 12 (7), 3030-3039 (2016);
doi:10.1021/acs.jctc.6b00242

Accurate and general treatment of electrostatic interaction in Hamiltonian adaptive resolution simulations
M. Heidari, R. Cortes-Huerto, D. Donadio, R. Potestio
The European Physical Journal Special Topics 225 (8-9), 1505-1526 (2016);
doi:10.1140/epjst/e2016-60151-6

Toward Hamiltonian Adaptive QM/MM: Accurate Solvent Structures Using Many-Body Potentials
Jelle M. Boereboom, Raffaello Potestio, Davide Donadio, Rosa E. Bulo
J. Chem. Theory Comput. 12 (8), 3441-3448 (2016);
doi:10.1021/acs.jctc.6b00205

Reply to comments by R. Klein on Advantages and challenges in coupling an ideal gas to atomistic models in adaptive resolution simulations
K. Kreis, A. C. Fogarty, K. Kremer, R. Potestio
The European Physical Journal Special Topics 224 (12), 2505-2506 (2015);
doi:10.1140/epjst/e2015-02533-5

Advantages and challenges in coupling an ideal gas to atomistic models in adaptive resolution simulations
K. Kreis, A. C. Fogarty, K. Kremer, R. Potestio
The European Physical Journal Special Topics 224 (12), 2289-2304 (2015);
doi:10.1140/epjst/e2015-02412-1

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