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B6 (N): Dynamisch konsistente vergröberte Modelle

Ziel des Projektes ist die Validierung vergröberter (CG) Polymermodelle mit Hilfe topologischer Kenngrößen. Wir fokussieren auf CG Modellen mit weichen Wechselwirkungen. Die Verteilung molekularer Knoten soll als Kenngröße dienen, um zu bestimmen, ob ein System topologisch äquilibriert ist. Weiterhin soll mit großskaligen Molekulardynamiksimulationen bei feiner Auflösung die Verteilung von Knoten in Polymerschmelzen als Funktion der Kettenlänge, Steifigkeit, und von geometrischen Einschränkungen bestimmt werden. Die Ergebnisse sollen als Referenzdaten zur Evaluation von vergröberten Modellen dienen und es sollen damit fundamentale Konzepte der Polymertheorie wie die Idealitätshypothese getestet werden.


Dynamic coarse-graining of polymer systems using mobility functions
Bing Li, Kostas Daoulas, Friederike Schmid
Journal of Physics: Condensed Matter 33 (19), 194004 (2021);
doi:10.1088/1361-648x/abed1b

Comparing equilibration schemes of high-molecular-weight polymer melts with topological indicators
Luca Tubiana, Hideki Kobayashi, Raffaello Potestio, Burkhard Duenweg, Kurt Kremer, Peter Virnau, Kostas Daoulas
Journal of Physics: Condensed Matter, (2021);
doi:10.1088/1361-648x/abf20c

A minimal Gō-model for rebuilding whole genome structures from haploid single-cell Hi-C data
S. Wettermann, M. Brems, J.T. Siebert, G.T. Vu, T.J. Stevens, P. Virnau
Computational Materials Science 173, 109178 (2020);
doi:10.1016/j.commatsci.2019.109178

Can Soft Models Describe Polymer Knots?
Jianrui Zhang, Hendrik Meyer, Peter Virnau, Kostas Ch. Daoulas
Macromolecules 53 (23), 10475-10486 (2020);
doi:10.1021/acs.macromol.0c02079

Generic Model for Lamellar Self-Assembly in Conjugated Polymers: Linking Mesoscopic Morphology and Charge Transport in P3HT
Cristina Greco, Anton Melnyk, Kurt Kremer, Denis Andrienko, Kostas Ch. Daoulas
Macromolecules 52 (3), 968-981 (2019);
doi:10.1021/acs.macromol.8b01863

Mapping onto Ideal Chains Overestimates Self-Entanglements in Polymer Melts
Hendrik Meyer, Eric Horwath, Peter Virnau
ACS Macro Letters 7 (6), 757-761 (2018);
doi:10.1021/acsmacrolett.8b00210

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